MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 12100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011981	GC	4	8	26396	26403	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
502	NC_011981	GC	3	6	26486	26491	0 %	0 %	50 %	50 %	222102430
503	NC_011981	ATG	2	6	26502	26507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102430
504	NC_011981	AGG	2	6	26512	26517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102430
505	NC_011981	CAA	2	6	26545	26550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102430
506	NC_011981	AG	3	6	26633	26638	50 %	0 %	50 %	0 %	222102430
507	NC_011981	GAA	2	6	26736	26741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102431
508	NC_011981	GCC	2	6	26752	26757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102431
509	NC_011981	TGC	2	6	26783	26788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102431
510	NC_011981	ATC	2	6	26803	26808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102431
511	NC_011981	C	6	6	26810	26815	0 %	0 %	0 %	100 %	222102431
512	NC_011981	GCCAAG	2	12	26838	26849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102431
513	NC_011981	CT	3	6	26863	26868	0 %	50 %	0 %	50 %	222102431
514	NC_011981	TCATGA	2	12	26870	26881	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	222102431
515	NC_011981	GAT	2	6	26946	26951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102431
516	NC_011981	GATG	2	8	26955	26962	25 %	25 %	50 %	0 %	222102431
517	NC_011981	TGC	2	6	26979	26984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102431
518	NC_011981	AT	3	6	26989	26994	50 %	50 %	0 %	0 %	222102431
519	NC_011981	TGG	3	9	27080	27088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102431
520	NC_011981	CAG	3	9	27105	27113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102431
521	NC_011981	CAT	2	6	27162	27167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102431
522	NC_011981	CCGC	2	8	27184	27191	0 %	0 %	25 %	75 %	222102431
523	NC_011981	ACC	2	6	27223	27228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102431
524	NC_011981	TCG	2	6	27313	27318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102431
525	NC_011981	ATG	2	6	27344	27349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102431
526	NC_011981	ACC	2	6	27364	27369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102431
527	NC_011981	TCA	2	6	27394	27399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102431
528	NC_011981	TTG	2	6	27481	27486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102431
529	NC_011981	GTCTC	2	10	27535	27544	0 %	40 %	20 %	40 %	222102431
530	NC_011981	CAT	2	6	27585	27590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102431
531	NC_011981	AGA	2	6	27629	27634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102432
532	NC_011981	GCC	2	6	27664	27669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102432
533	NC_011981	CAT	2	6	27688	27693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102432
534	NC_011981	CGA	2	6	27723	27728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102432
535	NC_011981	GCC	2	6	27742	27747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102432
536	NC_011981	CCA	3	9	27765	27773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102432
537	NC_011981	AGGC	2	8	27798	27805	25 %	0 %	50 %	25 %	222102432
538	NC_011981	GCA	2	6	27825	27830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102432
539	NC_011981	CAC	2	6	27859	27864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102432
540	NC_011981	GCC	3	9	28021	28029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102432
541	NC_011981	AGCCA	2	10	28038	28047	40 %	0 %	20 %	40 %	222102432
542	NC_011981	GCA	2	6	28092	28097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102432
543	NC_011981	CCAG	2	8	28134	28141	25 %	0 %	25 %	50 %	222102432
544	NC_011981	GCA	2	6	28157	28162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102432
545	NC_011981	CCA	2	6	28194	28199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102432
546	NC_011981	GAT	2	6	28246	28251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102432
547	NC_011981	TAAA	2	8	28274	28281	75 %	25 %	0 %	0 %	222102432
548	NC_011981	CGAAAT	2	12	28290	28301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	222102432
549	NC_011981	ACA	2	6	28304	28309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102432
550	NC_011981	GCC	2	6	28335	28340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102432
551	NC_011981	GCG	2	6	28344	28349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102432
552	NC_011981	TGT	2	6	28408	28413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102432
553	NC_011981	TCA	2	6	28437	28442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102432
554	NC_011981	AGGA	2	8	28445	28452	50 %	0 %	50 %	0 %	222102432
555	NC_011981	TAA	2	6	28455	28460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102432
556	NC_011981	CAG	2	6	28468	28473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102432
557	NC_011981	GCA	2	6	28542	28547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_011981	TGC	2	6	28555	28560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011981	ATT	2	6	28571	28576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102433
560	NC_011981	T	6	6	28622	28627	0 %	100 %	0 %	0 %	222102433
561	NC_011981	CAT	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102433
562	NC_011981	CTT	2	6	28760	28765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
563	NC_011981	GTT	2	6	28806	28811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102433
564	NC_011981	TTCCA	2	10	28924	28933	20 %	40 %	0 %	40 %	222102433
565	NC_011981	TTC	2	6	28963	28968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
566	NC_011981	GGCAAT	2	12	28983	28994	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222102433
567	NC_011981	CTT	2	6	28995	29000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
568	NC_011981	CTT	2	6	29063	29068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
569	NC_011981	GTC	2	6	29088	29093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102433
570	NC_011981	GCA	2	6	29119	29124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102433
571	NC_011981	GCC	2	6	29184	29189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102433
572	NC_011981	TGT	2	6	29198	29203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102433
573	NC_011981	AGGT	2	8	29296	29303	25 %	25 %	50 %	0 %	222102433
574	NC_011981	CTT	2	6	29349	29354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
575	NC_011981	TCA	2	6	29389	29394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102433
576	NC_011981	GTT	2	6	29478	29483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102433
577	NC_011981	TCA	2	6	29504	29509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102433
578	NC_011981	GTC	2	6	29583	29588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102433
579	NC_011981	GCG	2	6	29723	29728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102433
580	NC_011981	CTT	2	6	29730	29735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
581	NC_011981	GCC	2	6	29736	29741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102433
582	NC_011981	ATG	2	6	29743	29748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102433
583	NC_011981	CAT	2	6	29769	29774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102433
584	NC_011981	AGG	2	6	29783	29788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102433
585	NC_011981	TGC	2	6	29937	29942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102433
586	NC_011981	TCAT	2	8	29971	29978	25 %	50 %	0 %	25 %	222102433
587	NC_011981	TGC	2	6	30087	30092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102433
588	NC_011981	TTC	2	6	30106	30111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102433
589	NC_011981	AAG	2	6	30171	30176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102433
590	NC_011981	T	6	6	30197	30202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011981	AAGGC	2	10	30214	30223	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
592	NC_011981	AT	3	6	30233	30238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_011981	GAT	2	6	30323	30328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_011981	TTG	2	6	30350	30355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_011981	CGC	2	6	30397	30402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_011981	AGAA	2	8	30437	30444	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011981	T	6	6	30475	30480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011981	GTGA	2	8	30522	30529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011981	A	6	6	30601	30606	100 %	0 %	0 %	0 %	222102434
600	NC_011981	GC	3	6	30659	30664	0 %	0 %	50 %	50 %	222102434
601	NC_011981	ACC	2	6	30669	30674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102434
602	NC_011981	ACT	2	6	30721	30726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102434
603	NC_011981	CAA	2	6	30731	30736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102434
604	NC_011981	ATT	2	6	30744	30749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102434
605	NC_011981	A	6	6	30808	30813	100 %	0 %	0 %	0 %	222102434
606	NC_011981	TTG	2	6	30901	30906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102434
607	NC_011981	TGC	2	6	30908	30913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102434
608	NC_011981	TTA	3	9	30914	30922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102434
609	NC_011981	CAG	2	6	30945	30950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102434
610	NC_011981	GGTT	2	8	30958	30965	0 %	50 %	50 %	0 %	222102434
611	NC_011981	TGT	2	6	30985	30990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102434
612	NC_011981	GAT	2	6	31095	31100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102434
613	NC_011981	TAG	2	6	31247	31252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011981	AGCG	2	8	31337	31344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
615	NC_011981	GCT	2	6	31375	31380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102435
616	NC_011981	ACG	2	6	31424	31429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102435
617	NC_011981	CGG	2	6	31465	31470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102435
618	NC_011981	TCGCC	2	10	31522	31531	0 %	20 %	20 %	60 %	222102435
619	NC_011981	AC	3	6	31536	31541	50 %	0 %	0 %	50 %	222102435
620	NC_011981	GGC	2	6	31621	31626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102435
621	NC_011981	CCG	2	6	31629	31634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102435
622	NC_011981	AGG	2	6	31644	31649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102435
623	NC_011981	TCA	2	6	31725	31730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_011981	CG	3	6	31764	31769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_011981	GAA	2	6	32010	32015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222102436
626	NC_011981	TCT	2	6	32040	32045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102436
627	NC_011981	ACC	2	6	32087	32092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102436
628	NC_011981	GAAAT	2	10	32111	32120	60 %	20 %	20 %	0 %	222102436
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645	NC_011981	TC	3	6	32839	32844	0 %	50 %	0 %	50 %	222102436
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652	NC_011981	A	6	6	33520	33525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_011981	ATG	2	6	33557	33562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
654	NC_011981	GCC	2	6	33685	33690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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741	NC_011981	CAC	2	6	37248	37253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102439
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756	NC_011981	GAC	2	6	38232	38237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102440
757	NC_011981	TCGGA	2	10	38323	38332	20 %	20 %	40 %	20 %	222102440
758	NC_011981	GCA	2	6	38362	38367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102440
759	NC_011981	TGA	2	6	38408	38413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102440
760	NC_011981	ATG	2	6	38431	38436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102440
761	NC_011981	GTT	2	6	38513	38518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102441
762	NC_011981	CGG	2	6	38579	38584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102441
763	NC_011981	GCA	2	6	38707	38712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102441
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765	NC_011981	GGC	2	6	38858	38863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102441
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769	NC_011981	GCCTG	2	10	39121	39130	0 %	20 %	40 %	40 %	222102441
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771	NC_011981	ATC	2	6	39285	39290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102441
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773	NC_011981	ACC	2	6	39418	39423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102441
774	NC_011981	GAG	2	6	39449	39454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
775	NC_011981	GGCTC	2	10	39648	39657	0 %	20 %	40 %	40 %	222102442
776	NC_011981	CGGC	2	8	39673	39680	0 %	0 %	50 %	50 %	222102442
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782	NC_011981	GAA	2	6	40025	40030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
783	NC_011981	CGAA	2	8	40036	40043	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
784	NC_011981	CGA	2	6	40070	40075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_011981	CGG	2	6	40189	40194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_011981	CTT	2	6	40261	40266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102443
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789	NC_011981	CGA	2	6	40413	40418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102443
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791	NC_011981	GGC	2	6	40453	40458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102443
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794	NC_011981	GTGAAG	2	12	40537	40548	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
795	NC_011981	GA	3	6	40573	40578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
796	NC_011981	GGC	2	6	40624	40629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102444
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805	NC_011981	CGGCG	2	10	41191	41200	0 %	0 %	60 %	40 %	222102445
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834	NC_011981	GC	3	6	42729	42734	0 %	0 %	50 %	50 %	222102446
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850	NC_011981	CGA	2	6	43433	43438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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872	NC_011981	CTC	2	6	44484	44489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
873	NC_011981	GGCT	2	8	44563	44570	0 %	25 %	50 %	25 %	222102450
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